昌吉的大学主要有昌吉学院、新疆农业职业技术学院、昌吉职业技术学院等。昌吉学院坐落在新疆维吾尔自治区昌吉市，是区属普通高等学校。学校前身是成立于1959年的昌吉师范学校。
昌吉本科学校有哪些
| 学校名称 | 所在地 | 办学层次 | 备注 |
| 昌吉学院 | 昌吉回族自治州 | 本科 | 公办 |
昌吉专科学校有哪些
| 学校名称 | 所在地 | 办学层次 | 备注 |
| 新疆农业职业技术学院 | 昌吉回族自治州 | 专科 | 公办 |
| 昌吉职业技术学院 | 昌吉回族自治州 | 专科 | 公办 |
2022新疆新建高等职业学校
| 学校名称 | 审批机关 | 备注 |
| 和田职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区人民政府 | 公办 |
| 铁门关职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区人民政府 | 公办 |
| 石河子工程职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区人民政府 | 公办 |
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