医保和农村合作医疗有什么区别?实际概念上是比较混淆的，农村合作医疗也是医保，正确的问法应该是城镇职工医疗保险和农村合作医疗有什么区别?
第一，我国基本医疗保险的种类。
目前，作为社会保险中的基本医疗保险分为“城镇职工医疗保险、新型农村合作医疗保险、城镇居民医疗保险”三大类型。2016年1月，国务院发布了(2016)3号文件，即《国务院关于整合城乡居民基本医疗保险制度的意见》，正式将以前的新型农村合作医疗保险、城镇居民医疗保险整合为“城乡居民医疗保险”。整合后，目前我国社会保险中的医疗保险分为城镇职工医疗保险、城乡居民医疗保险两大类型。随着全国各地整合进度的逐步加速，目前大部分地方，农村合作医疗保险已经被城乡居民医疗保险所代替。
第二，城镇职工医疗保险和城乡居民医疗保险的区别。
一是参保对象不同。职工医疗保险参保对象为城镇在岗职工和灵活就业人员;城乡居民医疗保险(新农合)主要为没有参加城镇职工医疗保险的城乡居民，目前农村居民参保比例远远大于城镇居民。
二是缴费方式不同。职工医疗保险在岗职工是按照单位和个人缴费相结合的方式，缴费比例为8%，其中单位缴费为6%记入医疗基金，个人缴费为2%记入个人账户;灵活就业人员缴纳职工医疗保险的，缴费比例为8%，全部由个人承担缴费;新农合(以下称为居民医疗保险)采用国家补助和个人缴费相结合的方式，其中国家补助和个人缴费全部计入医疗基金，没有个人账户，个人缴费每年220元左右。
三是享受待遇不同。职工医疗保险报销比例比居民医疗保险高，一般到70%左右，居民医疗保险报销比例除了社区街道医院以外，大医院只有30%左右;职工医疗保险有个人账户，居民医疗保险没有个人账户。
第三，职工医疗保险可享受医保退休，而居民医疗保险不能享受医保退休。
职工医疗保险实行缴费年限累计计算，由于缴费金额比较高，在达到规定的缴费年限以后，退休后不再缴纳医疗保险而终身享受医保待遇;城乡居民医疗保险采用交一年享受一年的政策，缴费比较低，每年220元左右，缴费年限不累计计算，退休后还需要缴纳居民医保才能享受医保待遇。
综上所述，职工医疗保险和居民医疗保险都属于社会保险中医疗保险的范畴，但是由于两种医疗保险之间，存在参保对象、缴费方式、待遇享受等方面的巨大的差异，作为参保者，应根据自己的实际情况和经济能力，选择符合自己需要的医疗保险进行参保。需要注意的是，职工医疗保险只有参加职工养老保险的人员才能参保，不能单独参保职工医疗保险，居民医疗保险是所有人都可以参保，但不能同时参保两种医疗保险，重复参保不能重复报销。
