首先，备案编制的出现本身就是为了解决医院、高校等事业单位发展与编制之间的矛盾，提高单位的创新发展活力，是提升单位自主用人的一种制度创新。备案编制对于招聘单位本身来说，和事业编制的区别并不是很大，也需要按照严格招聘用人程序才能够招聘使用，在个人的经济待遇上，本身和在职人员并没有区别，属于地方财政供养人员，但是，对于其退休如何处理，现在并没有出台相关政策文件，除此之外，在单位内部备案制员工和在编职工的区别并不是很大。
其次，对于备案编制来说，虽然在单位内部和在编人员类似，但是两者之间还是有着严格的区别。一方面，对于参加编制考试的应聘者来说，顺利入职以后除了获得入编的机会以外，还有就是干部的身份，而这个对于个人以后的发展是至关重要的，事业单位编制人员有着干部身份，而备案编制人员并没有这样的身份，因此，在提拔使用上来说，备案编制是很难有机会的，即使破格提拔使用，也只能以负责人的身份在本单位内部进行职务任用，并不能按照组织规定，走干部提拔任用的程序。
另一方面，对于事业编制人员来说，是可以在其他事业单位之间进行流动的，或者在机会合适的情况之下，可以根据规定转任为公务员，虽然这样的机会比较稀少，但是现在这条通道仍然是可以行得通，而对于备案编制人员来说，是没有任何调动的机会，虽然在本单位内部，备案编制和事业编制没有区别，但是离开了单位的职称，事业编制仍然是事业编制，有着法律法规作为依据，而备案编制则有可能变得没有意义。很多时候，备案编制的主体是单位，并不是个人。
最后，虽然备案编制和事业编制存在着一定的差距，但是在实际工作生活之中，体现的并不是很明显。对于事业单位来说，能够被提拔的始终是个别人员，而能通过提拔最后转为公务员的更是少之又少，因此，如果在考公务员或者事业单位多次失利的前提下，考取备案编制也是一种不错的选择，而且在考取以后，随着改革的不断深入，后期的变化也许会变得更好，直至和事业编制不存在任何区别，这都是有可能的，不过，现在的备案编制本身也不好考，而且对专业的要求更加严格。
